北京同仁堂中医医院创建于2008年12月29日，位于北京市东城区西打磨厂街46号，医院原址为清康熙八年(公元1669年)，时任清宫太医院高级医官的乐显扬开创的“同仁堂”药室。这里曾经是同仁堂创始人乐家在置办同仁堂大栅栏药店前的第一份产业，也是同仁堂兴起时“前店后厂”中的药厂，这里可以称之为同仁堂历史的发源地。医院于2009年成为北京市医保定点专科医院，2011年晋升为二级中医医院。
医院开设有内科、妇科、耳鼻喉科、肿瘤科、眼科、儿科、针灸科、推拿科、骨病科、皮肤科、治未病科、肛肠科和风湿科等多个临床专业科室。并设有专家门诊和贵宾门诊，诚聘包括全国名中医、首都国医名师、全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师、北京市老中医药专家学术经验继承工作指导老师、北京市中医药传承“双百工程”指导老师、北京市优秀名中医、东城区知名中医师等知名中医专家近百人。诊疗范围覆盖内、外、妇、儿、皮、肿瘤等多学科，除中药治疗外，还开展了多种特色诊疗服务，集针、药、刀(小针刀)、罐、推拿等多种治疗手法为一体，疗效切实，受到患者的认可和信赖。
医院配备64排128层CT、1.5T磁共振机等大型医疗检查设备，并开展了如彩色多普勒超声检查，眼科、耳鼻喉科检查及近两百项检验项目。
医院开设住院病房，并确立脑病专科和内分泌专科为院级重点专科，实现“前门诊、后病房”的专科化管理。
医院目前拥有全国名老中医工作室2个，国家级中药调剂技能大师工作室1个，北京中医药薪火传承“3+3”工程——名老中医工作室及基层老中医传承工作室3个，东城区名中医工作室2个。这些工作室为医院培养了很多优秀的中医中药人才。医院还为担任高级卫生专业技术职务的医生建立专家工作室，承续同仁堂传统，惠泽于人民大众。
医院充分发挥同仁堂的中药优势，以同仁堂地道药材、精制饮片、经典中成药为支撑，传播和弘扬同仁堂诚信质量文化，始终坚持“炮制虽繁必不敢省人工，品味虽贵必不敢减物力”的同仁堂古训，与高水平中医专家一起为广大患者提供一份“名医+名药”的双重保障。
北京同仁堂中医医院将秉承“同修仁德，济世养生”的核心理念，热忱为来自全国及世界各地的广大患者提供传统、优质、周到、温馨的中医药医疗服务。
